省級亳州經濟技術開發區是1993年經安徽省人民政府批準設立的省級開發區，2013年7月與亳州市南部新區進行整合，現轄區面積100平方公里，經濟區域面積50平方公里，下設6個管理區。   分為南區和北區，分別位于亳州城東南部和南部，北區位于京九鐵路以東、依偎渦河灣，規劃面積5.66平方公里，以開發旅游觀光、休閑娛樂、度假、商貿市場、現代物流為主。南區即原亳州市南部新區，規劃面積88平方公里，入駐企業97家。開發區以外向型經濟和高新技術產業為主導，著力發展中醫藥高新技術產業和現代工業，配套發展高檔次三產服務業。目前，開發區在規模基礎設施及首批進區項目正在建設之中。